Nachdem Mulder offenbar von Außerirdischen entführt wurde, werden Scully und Direktor Skinner vom FBI plötzlich wie Verdächtige behandelt. Zudem bekommen sie Agent Doggett vor die Nase gesetzt, der die Sondereinheit leitet, die Mulder ausfindig machen soll. Aber dann stößt Scully auf Hinweise, dass nicht nur Mulder als Entführungsopfer auserkoren wurde.
Als ein britisches und ein sowjetisches U-Boot spurlos verschwinden, wird Super-Agent James Bond zusammen mit seiner hübschen russischen Kollegin Anya Amasova auf den mysteriösen Fall angesetzt. Gemeinsam sollen sie die bösen Pläne von Bonds Erzfeind, dem größenwahnsinnigen Bösewicht Karl Stromberg, durchkreuzen, der die Welt mit Atombomben, die auf Moskau und New York City gerichtet sind,... James Bond 007 - Der Spion, der mich liebte