Deputy Director Kersh konfrontiert Scully mit mysteriösen Abdrücken, die stark an jenes außerirdische Raumschiff erinnern, das zwei Jahre zuvor vor der Küste Westafrikas gefunden worden war. Die Spur führt zu FBI-Agent Robert Comer, der eine UFO-Sekte infiltrieren sollte und dann die Seiten wechselte.
Jetzt wird Comer zur tödlichen Gefahr für Scullys kleinen Sohn William.